Фонд создан «в целях популяризации российской истории в нашей стране и за рубежом, сохранения исторического наследия и традиций народов России, поддержки программ исторического просвещения».
Учредителем организации является правительство России. Его имущество формируется за счет федерального бюджета, добровольных имущественных взносов и пожертвований.
Председателя и членов совета фонда — высшего коллегиального органа организации — будет назначать сам президент. Руководить фондом будет правление во главе с исполнительным директором, надзором за деятельностью фонда займется попечительский совет. Фонд будет находиться в Москве.
Путин уже назначил состав совета «Истории Отечества». В него вошли руководители музеев, в частности глава Эрмитажа Михаил Пиотровский, представители Минкульта и институтов РАН, а также спикер Госдумы Сергей Нарышкин.