Оценки Дейтона и его итогов различны. Сербам казалось, что мусульмане в Дейтоне имели преимущество. Сербские предложения никто серьезно не рассматривал. Н.Колевич, один из лидеров Республики Сербской, заявил тогда, что целью организаторов переговоров «было достижение хоть каких-то соглашений, а отнюдь не нахождение справедливого решения».
Мусульманская сторона тоже была недовольна итогами Дейтона. Министр иностранных дел БиГ М.Шачирбегович отмечал: «Думаю, что мы имели лучшую ситуацию, когда только ехали в Дейтон, чем ту, которая получилась после Дейтона. Я думаю, что мир не достигнут в Дейтоне... Дейтон как концепция, как метод работы... где уламывают, был нашей ошибкой».
Хорватская сторона, судя по всему, видела заключенные соглашения как временную меру, необходимую для достижения основной цели — присоединения частей Боснии и Герцеговины, населенных хорватами, к Хорватии.
На Западе большинство политиков восприняли мирные соглашения как большой успех, положивший конец самому кровопролитному конфликту в Европе со времен Второй мировой войны. Российская дипломатия оценила Дейтон достаточно сдержанно, хотя скорее положительно, чем отрицательно.
Согласно Дейтонскому договору, государство Босния и Герцеговина состоит из двух Образований – Федерации БиГ (мусульманско-хорватская федерация) и Республики Сербской (РС). Дейтонские соглашения — плохо проработанный документ. В тексте заложено глубокое противоречие между политическими задачами создания единого государства Боснии и Герцеговины и установлением линий разграничения между тремя Образованиями. Поэтому в целом государство функционировало со скрипом, а сербы обернули это противоречие в свою пользу, стали создавать и укреплять республику.
Такая надуманная, не имеющая аналогов в мире структура государства изначально была рассчитана на короткое существование. На наш взгляд, Дейтонский договор писали в Вашингтоне как временный документ: мол, сербы успокоятся, получат свою автономию в виде «Образования», а затем под жёстким контролем США и Высокого представителя начнут передавать свои полномочия Сараеву. Тогда удастся мирным путём создать централизованную Боснию и Герцеговину. Этим путём БиГ и шла до 2006 года: Высокий представитель управлял, сербы молчали и шли на уступки.
